Para tener éxito en un programa de mejoramiento genético es indispensable disponer de amplia variabilidad genética para utilizarla en los cruzamientos y selección. En el CINCAE se conservan 601 variedades introducidas, cuatro variedades nacionales y  110 clones promisorios de siete series de selección (1998 a 2004). La mayoría (90 %) de estos materiales genéticos se han evaluado y caracterizado morfológica y agronómicamente y se están realizando trabajos de diversidad genética a través de marcadores moleculares del tipo microsatélites. Todos los años ingresan nuevos cultivares provenientes de introducciones de otros centros de investigación y se incluyen los clones promisorios que han alcanzado el estado IV en una serie de selección. Los genotipos sobresalientes y representativos de la variabilidad existente en la colección, se seleccionaron para formar un grupo o colección de trabajo que se lo denomina “colección activa”, la que sirve de base para los trabajos de cruzamientos y otras evaluaciones.